เวอร์ชั่น DS เคียวจอมมารมันมีอันที่สุดยอดกว่านั้นอีกมั้ง (แต่ลืมไปแล้วว่าเอาจากดันเจี้ยนลับอันไหน) โดยอาวุธนั้น ถ้าใช้โจมตีแล้วติดคริติคอล จะให้ดาเมจสูงสุด 4 เท่าเลยทีเดียว

ส่วนฉากจบลับภาคนี้
1. ต้องมีจอมมารอยู่ในกลุ่ม (ไม่แน่ใจไม่คอนเฟิร์ม แต่เล่นทุกรอบเอาจอมมารเข้ากลุ่มทุกรอบ)
2. จบแบบที่ 1 โดยยานซิลเบิร์ดพังหรือไม่ก็ได้ (Black Omen ต้องทำลายด้วยมั้ยนี่ไม่แน่ใจ แต่ผมเล่นแบบผ่าน Black Omen) หลังจากเล่นจบเกมแล้ว พอดูฉากจบหมดแล้วจะมีดันเจี้ยนลับโผล่มาทั้งหมด 3 ยุค
3. ไปเคลียร์ดันเจี้ยนทั้ง 3 ในยุค BC12000 AD1000 และ AD2300
4. หลังจากเคลียร์หมดทั้ง 3 ดันเจี้ยนลับ 3 ยุคแล้ว ให้กลับไปที่จุดสิ้นสุดกาลเวลา คุยกับคนแก่ที่ยืนหลับอยู่ เขาจะบอกเกี่ยวกับ Time's Eclipse จากนั้นไปสำรวจแท่นที่ใช้วาร์ปไปยัง วันแห่งลาวอส ในปี 1999 แต่ มันจะมีหัวข้อใหม่โผล่มา
5. เข้าไปแล้วจะพบกับจอมมารที่พยายามหาทางช่วยใครบางคน จากนั้นปราบบอสให้ได้ ก็จะจบแบบที่ 13
อนึ่ง เมื่อจบฉากจบนี้ หลังจากเซพเกมแล้วจะได้รับดาบ Dream Seeker ซึ่งเป็นอาวุธที่สุดยอดกว่า Rainbow ของโครโน่

เนื้อเรื่องพิเศษใน Lost Sanctum (ค่อนข้างยาวหน่อยนะ เพราะมันเหมือนบทสรุปกลายๆ)
โผล่มาหลังจากเหตุการณ์ที่โครโน่โดนลาวอสสังหาร (ยานซิลเบิร์ดติดปีกแล้ว) โดยจะมี Lost Sanctum โผล่มา ในยุค BC65 ล้านปี กับ AD600

โดยจุดลงจอดต้องใช้ยานซิลเบิร์ดจอดเท่านั้น (ที่ BC65 ล้านปีจะมีตำแหน่งจอดตายตัวแค่จุดเดียว ลองคลำๆดู ส่วนใน AD600 ต้องไปจอดข้างๆป่าของปราสาทปิศาจบิคาเนลเท่านั้น)

เริ่มต้นเควส ให้ไปที่ BC65 ล้านปีก่อน เข้าไปในหมู่บ้านจะพบว่าหมู่บ้านมันร้าง ให้เข้าไปในป่าทางด้านขวาบนของหมู่บ้าน กำจัดมอนสเตอร์ให้หมด ถ้าหมดแล้วจะมีเหตุการณ์พวกเราคุยกัน แล้วกลับมาที่หมู่บ้าน ชาวเมืองไดโนเสาร์จะออกมา (ในส่วนนี้ถ้าเราเข้ามาที่นี่ในปี AD600 จะพบว่า มอนสเตอร์ครองถิ่นไปแล้ว) หลังจากชาวบ้านไดโนเสาร์โผล่มา คราวนี้ก็รับเควสฟื้นฟูชาวเมืองไดโนเสาร์กัน

คุยกับคนซ้ายล่างสุดของหมู่บ้าน เขาต้องการค้อนทองคำ ให้เข้าไปในป่าของ BC65 ล้านปี ที่มุมขวาบนอีกรอบ กำจัดมอนสเตอร์ให้หมด สุดทางจะเห็นต้นไม้อยู่ต้นนึงให้สำรวจพวกเราจะปลูกต้นไม้ทองคำกัน

บินไปยุค AD600 ไปยังจุดที่เราปลูกต้นไม้ จะพบว่าต้นไม้มันหายไป แต่จะมีมอนสเตอร์ตัวหนึ่งถือค้อนทองคำ ให้ออกตามล่าแล้วเอาชนะให้ได้

เอาค้อนไปให้มนุษย์ไดโนเสาร์ในปี BC65 ล้านปี ก็จะจบเควสที่ 1
เควส 2 คุยกับมนุษย์ไดโนเสาร์คนซ้ายบน เขาต้องการหิน Prismastone มาช่วยลูกสาวของเขา แต่เผอิญว่า มีปิศาจนูว ขวางทางขึ้นภูเขา ทำให้ไปเอาไม่ได้ ให้ลองคุยกับคนในหมู่บ้านอีกรอบ จากนั้นลงป่ามาทางด้านล่างไปทางตะวันออก จะพบนูวขวางทางอยู่ เอาชนะให้ได้ (สามารถขโมยอาวุธสุดกระจอก ไม้ถูพื้น ของโครโน่ได้นะ) หลังจากชนะ นูวจะบ่น แล้วบอกว่าจะลับฝีมือมาสู้กับเราใหม่ แล้วหนีไป ให้ขึ้นไปบนเขาด้านบนสุด จะพบวกับหิน Prismastone ให้นำกลับมาให้ชาวบ้านคนเดิม ก็จะได้รับรางวัล

เควส 3 ไปยัง AD600 ตรงไปยังภูเขามรกต จะพบว่า บันไดมันขาด
บินกลับมาที่ BC65 ล้านปี คุยกับชาวบ้านจะได้ข้อมูลของหญ้าชนิดหนึ่งที่สามารถทำบันไดได้ ให้เราเอามา แล้วไปที่ภูเขามรกต ปีนบันไดที่ขาดในยุค AD600 ขึ้นไปพวกเราจะทำบันไดสแปร์ไว้ 1 อัน
กลับมายังยุค AD600 ปีนไปยังยอดเขา จะพบกับนูวเวอร์ชั่นอัพเกรด พอชนะแล้วเขาจะบ่นว่า ทั้งๆที่ลับฝีมือเป็นล้านๆปี ทำไมยังเอาชนะพวกโครโน่ไม่ได้ เพื่อนๆของเราจะบอกว่า เพราะแกไม่มีเพื่อนที่คอยช่วยเหลือในการต่อสู้ สรุปมันขอเป็นเพื่อนกับพวกเรา แล้วมาเล่นหลับตรงทางสะพานที่เราจะไปต่อ

เควส 4 กลับหมู่บ้านในปี AD600 คุยกับชาวบ้าน จะมีอยู่คนหนึ่ง ทางขวาๆของหมู่บ้าน (ด้านล่างของที่พัก) เขาต้องการค้อน และ ไม้ในการซ่อมสะพาน ให้เรากลับไปยัง BC65ล้านปี คุยกับคนที่เราเอาค้อนให้เขาไปในเควสแรกสุด แล้วเข้าไปที่ป่ามุมขวาบน คุยกับมนุษย์ไดโนเสาร์เพื่อขอไม้มา จากนั้น ตามหา Steel Ingot (ลืมแล้วว่าได้จากไหน) ให้เราเอากลับไปให้มนุษย์ไดโนเสาร์ เขาจะไปทำสะพานให้เรา..
เดินวนไปวนมาซักพัก ไปคุยกับไดโนเสาร์ที่อยู่บ้านข้างๆของหลังที่เราขอช่วยทำสะพานให้ เขาจะบ่นว่า เพื่อนเขายังไม่กลับมา ฝากวานให้ไปดูให้หน่อย
ให้เราปีนเขาไป จะพบกับนูวที่ยังนั่งหลับอยู่ ให้คุยเขาจะเปิดทางให้ พอเข้าไปถึงจะพบกับมนุษย์ไดโนเสาร์ที่กำลังแย่เพราะจะตกสะพาน เมื่อช่วยได้แล้ว เขาต้องการผู้ช่วยซ่อมสะพานคนนึง ให้เราไปชวนนูวมาช่วยทำ
แต่พอนูวทำไปซักพักเขาจะหิว ให้เรากลับไปที่หมู่บ้าน คุยกับชาวบ้านจะได้อาหารมา เอากลับมาให้นูว แต่นูวกินแล้วบอกว่ายังหิว ให้เรากลับไปหมู่บ้านอีกครั้ง แต่คราวนี้ ให้บินกลับไปที่ BC65 ล้านปี คุยกับชาวบ้านจะมีคนให้ข้อมูลของอาหาร ให้เราปีนเขามรกต แล้วปราบมอนสเตอร์ จะพบเห็ดชนิดหนึ่ง เอากลับมาให้นูว แต่เขาก็ยังหิวอีก แล้วเขาบอกว่าขอของกินที่เป็นสีเหลืองๆ ในยุคเก่านานมากๆๆแล้ว ให้บินกลับไปที่ BC65 ล้านปีอีกรอบ เข้าไปในป่าด้านล่างของหมู่บ้าน สำรวจแถวๆจุดที่เราได้หญ้าทำเชือกบันได ฆ่ามอนสเตอร์หมดจะได้กล้วยมา เอากลับมาให้นูว คราวนี้เขาจะทำสะพานให้เรา

เควส 5 กลับไปยังป่าขวาบนของหมู่บ้านในยุค AD600 ลองสำรวจที่มุมซ้ายบนของฉาก จะได้ไอเท็มชิ้นนึง Raptmark เอาไปให้หัวหน้าหมู่บ้านดูเขาจะเปิดทางให้เรา ตรงนี้ยังไม่ต้องทำอะไร ในตัวเราตอนนี้จะมี Prismastone อยู่ 1 ก้อน ให้เราเอาไปวางในห้องหัวหน้าหมู่บ้านในยุค BC65 ล้านปีที่แล้ว วางไว้ด้านไหนก็ได้ แล้วไปยังยุค AD600 ไปหยิบก้อนหิน ที่เราวางไว้ จากนั้นเอากลับมาวางอีกแท่นนึงในยุค 65 ล้านปี จะได้หิน Saintstone มาจากนั้นคุยกับชาวบ้านจะได้ข้อมูลของหินเพิ่มเติม (ชาวบ้านงงเรื่องการข้ามเวลาไปเอาของจากอนาคตมารวมกับของในอดีต) จากนั้นเอาไปวางที่ยอดเขามรกต ที่จุดที่เราได้ Prismastone ตอนแรก แล้วบินไปยังยุค AD600 จะพบกับหินที่อาบแสงจนกลายเป็น Waystone ไปแล้ว ให้เอากลับมาที่หมู่บ้านยุค 65ล้านปีอีกครั้ง แล้วคุยกับชาวบ้านที่ให้ข้อมูลของถ้ำมืดๆทางตะวันตก จากนั้นวิ่งไปที่ถ้ำตะวันตก จะพบมอนสเตอร์ หลังจากพวกเราขุดดันเจี้ยนพบที่ใหม่แล้ว จะมีการปรึกษาของคนในหมู่บ้าน จากนั้นให้กลับไปที่ถ้ำตะวันตกอีกครั้ง จะพบว่ามอนสเตอร์เริ่มรุกล้ำหมู่บ้านแล้ว ให้ไล่กำจัดให้หมด จากนั้นเข้าไปจัดการกับบอสข้างในสุด จบเควสนี้จะได้รับ Valor Crest เครื่องประดับของเอร่าที่มีคุณสมบัติเพิ่มอัตราคริติคอล และ สวนกลับ 50% (ยิ่งเอร่าเลเวล 99 ไม่ต้องคุยเรื่องดาเมจเวลาติดคริติคอล)

เควส 6
ต้องจบเควสที่ 5 แล้วเท่านั้น จากนั้นไปยังหมู่บ้านในยุค AD600 ตรงไปยังสะพานที่ซ่อมอยู่ เมื่อไปถึงจะพบว่าสะพานซ่อมเสร็จ คราวนี้พวกเรากลับมาที่หมู่บ้านกัน เมื่อคุยกันได้พักนึง จะมีชาวบ้านมาบอกว่ามอนสเตอร์บุก และพบว่ามอนสเตอร์อยู่ในหอคอย ที่เหลือก็แค่หน้าที่เราที่จะต้องจัดการให้หมดอีกรอบ ระหว่างทางก็เก็บดาบขึ้นสนิมมาด้วยล่ะ เมื่อจัดการบอสแล้ว พอเข้าไปยังห้องข้างในสุดแล้ว จะมีเหตุการณ์พวกเรากลับออกมาจะได้รับตราแชมเปี้ยนของคาเอล ซึ่งทำให้คาเอลตอนสวมใส่ดาบแกรนริออน สามารถใช้เวทหรือท่าโดยเสีย Mp แค่ครึ่งเดียว นอกจากนี้ ถ้าเอาดาบขึ้นสนิมไปให้ช่างอาวุธในหมู่บ้านไดโนเสาร์ของยุค 65 ล้านปี ก็จะได้รับดาบของมังกรฟ้ามาอีกด้วย

List Ending ในเกมทั้งหมด
0. แพ้ลาวอส ในปี AD1999
1. จัดการลาวอสหลังจากผ่านเหตุการณ์ช่วยชีวิตโครโน่ด้วยโครโน่ทริกเกอร์แล้ว โดยฉากจบนี้จะเปลี่ยนไปตามยานซิลเบิร์ดของเรา
2. จัดการลาวอสหลังจากโครโน่ตายและไม่ได้หาทางช่วยชีวิตโครโน่
3. เริ่ม New Game + มา ได้มาร์ลเข้ากลุ่มแล้วไปสำรวจเครื่องวาร์ปด้านขวา แล้วจัดการลาวอส โดยต้องทำก่อนจะวาร์ปไปยุค AD600
4. จบเหตุการณ์ช่วยมาร์ลในยุค AD600 แล้วไปจัดการลาวอสด้วยวิธีเดียวกับจบแบบ 3 แต่ต้องทำก่อนเยือนจุดสิ้นสุดการเวลา
5. หลังจากออกมาจากจุดสิ้นสุดของเวลาแล้ว ให้ไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนจะกลับไปยังยุค AD600 เท่านั้น
6. หลังจากเข้ามาในยุค AD600 รอบที่ 2 จัดการกับบอส Zombor ที่สะพานแล้ว ให้ไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนจะได้รับสัญลักษณ์ผู้กล้าจาก Tata
7. หลังจากได้สัญลักษณ์ผู้กล้าจาก Tata ให้ไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนที่ Gate Key จะโดนขโมยไปในยุค BC65 ล้านปี
8. หลังจากชิง Gate Key กลับมาได้แล้ว ให้ไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนจะส่งมอบดาบ masamune (หรือแกรนริออน) ให้กับคาเอล (Frog)
9. หลังจากคาเอล (Frog) สามารถใช้ดาบเปิดถ้ำได้แล้ว ให้ไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนจะสู้กับจอมมาร Magus
10. หลังจากปะทะ Magus แล้วหลุดไปยังยุค BC65 ล้านปี ให้กลับมาจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนสู้กับ Azala ที่ปราสาทไทแรนโน
11. หลังจากลาวอสหล่นมาทำลายปราสาทไทแรนโนแล้ว ให้กลับไปจบเกมได้เลย แต่ต้องทำก่อนที่เหตุการณ์ซาร่าเปิดประตูผนึกเข้าห้องราชินีซีลปี BC12000
12. หลังจากซาร่าเปิดประตูผนึกเข้าห้องราชินีซีลในปี BC12000 แล้ว ให้กลับไปฆ่าลาวอส (ห้ามทำเหตุการณ์หลังจากนี้มิฉะนั้นจะจบแบบที่ 11)
13. เคลียร์ฉากจบลับ หลังจากจบเกมไปแล้ว 1 รอบ

เพิ่มๆ ในยุค BC12000 ถ้ายังมีเกาะลอยฟ้าอยู่ ให้ไปที่ Kajar แล้วลองสำรวจหนังสือธาตุทั้ง 3 เล่มดู โดยเราสามารถเปิดประตูลับได้จากกลอนบทนึงที่มอนสเตอร์ในนั้นได้กล่าวไว้ว่า
Water Summons wind
wind makes fire dance
แล้วก็ออกมาสำรวจหนังสือตามกลอนที่กำหนดจะมีประตูลับโผล่มา เข้าไปแล้วจะได้รับเครื่องประดับ Black Gemstone ซึ่งไว้ใช้ท่าประสานอีกท่านึงของ จอมมาร มาร์ล และ ลุคก้า